Administracja
- Kierownictwo Administracji
- Sekretariat Kanclerza
- Dział Kadr
- Sekcja Socjalna
- Biuro ds. Kształcenia
- Biuro ds. Nauki i Współpracy z Gospodarką
- Biuro ds. Osób Niepełnosprawnych
- Biuro ds. Projektów Europejskich
- Biuro ds. Studenckich
- Biuro ds.Współpracy Międzynarodowej
- Biuro Informatycznej Obsługi Studiów
- Biuro Kontroli Wewnętrznej
- Biuro Mediów i Promocji
- Biuro Rektora
- Dyrektor Gabinetu Rektora
- Dział Bezpieczeństwa i Higieny Pracy
- Dział Gospodarki Nieruchomościami
- Dział Telekomunikacji
- Dział Inwentaryzacji
- Dział Inwestycji i Nadzoru Budowlanego
- Dział Obsługi Gospodarczej i Terenów Zieleni
- Dział Obsługi Obiektów Dydaktycznych
- Dział Obsługi Technicznej i Utrzymania Infrastruktury
- Dział Zabezpieczenia Logistycznego
- Dział Zamówień Publicznych
- Kwestura
- Rozdzielnia Korespondencji
- Rzecznik Patentowy
- Dział Planowania i Analiz
- Stanowisko ds. Energetycznych
- Stanowisko ds. Gospodarki Odpadami
- Stanowisko ds. Obronnych i Informacji Niejawnych
- Stanowisko ds. Ochrony Przeciwpożarowej
- Straż Uniwersytecka
- Wydawnictwo Uniwersytetu
- Zakład Poligraficzny
- Zespół Audytu Wewnętrznego Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie
